PROYECTO AL12-P( I+D)- 05

TÍTULO:

Caracterización genómica y fenotípica de bacterias de suelos alcalinos mexicanos de Chiapas capaces de nodular eficientemente Lupinus mariae-josephae

PARTICIPANTES:

Universidad Politécnica de Madrid, España

Responsable: Luis Rey Navarro               Profesor Titular de Universidad

Participantes: Tomás Ruiz-Argüeso         Catedrático de Universidad
Juan Imperial Ródenas Profesor de Investigación CSIC

David Duran Wendt     Becario predoctoral
                                   Víctor Pastor Martín Becario grado

Carmen Sánchez Cañizares Becario predoctoral

Beatriz Jorrín Rubio Becario predoctoral

Dirección
Universidad Politécnica de Madrid
Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas
Campus de Montegancedo
Autovía M-40, Km 38
28223 Pozuelo de Alarcón (Madrid)

Teléfono:       34-91-3364570
Fax:              34-91-7157721
Contacto:      luis.rey@upm.es

Centro de Ciencias Genómicas. Universidad Autónoma Nacional de México, Cuernavaca, México

Responsable: Esperanza Martínez Romero                Investigador Titular
Participantes: Ernesto Ormeño Orrillo                       Investigador postdoctoral

Dirección
Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Apdo. Postal 565-A, Cuernavaca, Morelos, México

Teléfono:      527773131697
Fax:             527773175581
Contacto:     emartine@ccg.unam.mx

OBJETIVOS DEL PROYECTO

Caracterización de bacterias de suelos alcalinos mexicanos de Chiapas capaces de nodular eficientemente Lupinus mariae-josephae para una posible ampliación del área de distribución de este Lupinus.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS

- Objetivo 1. Estudiar las propiedades simbióticas de las cepas de Chiapas, eficientes con L. mariae-josephae, frente a plantas Lupinus spp, Retama spp., Macroptilium atropurpureum, Vigna unguiculata etc.

Se estudiarán y compararán también otras propiedades fenotípicas como su perfil de MALDI-TOF, resistencia a antibióticos y capacidad de crecer con diferentes fuentes de carbono y nitrógeno. Esta técnica ya se ha mostrado útil en la taxonomía molecular de bacterias endosimbióticas de leguminosas (Prabhu et al, 2007)

- Objetivo 2. Establecer la relación filogenética de las cepas aisladas de Chiapas frente a cepas ya caracterizadas de L. mariae-josephae (Sánchez-Cañizares et al., 2011). Para llevar a cabo este objetivo se obtendrán secuencias de varios genes de los aislados de Chiapas (16S rRNA, recA, glnII y atpD) ya utilizados para elaborar árboles filogenéticos de bradirrizobios. A partir de los resultados que se obtengan se seleccionarán un número restringido que reflejen la diversidad de estas bacterias para secuenciar sus genomas mediante técnicas de secuenciación masiva. Las secuencias que se obtengan permitirán establecer la posición taxonómica e interespecífica de estas cepas.

- Objetivo 3. A partir de los genomas se identificarán la presencia de determinantes genéticos implicados en el transporte de Fe. También se llevará a cabo un estudio comparativo de crecimiento en medios con condiciones limitantes de Fe.

Referencias
- Prabhu, R. R. M. J. Kulkarni, V. A. Parasharami, B. Santhakumari and S. Paranjape. (2007). An attempt at taxonomical characterization of some Rhizobial species by intact cell MALDI mass spectrometry. World Journal of Microbiology and Biotechnology 23:177-185
- Sánchez-Cañizares, C., Rey, L., Durán, D., Temprano, F., Sánchez-Jiménez, P., Navarro, A., Polajnar, M., Imperial, J., Ruiz-Argueso, T (2011). Endosymbiotic bacteria nodulating Lupinus mariaejosephi, a new lupine endemic of alkaline soils in Eastern Spain, represent a new lineage within Bradyrhizobium genus. Systematic and Applied Microbiology, en prensa.

Figura 1. Plantas de Lupinus mariae-josephae. Izda y centro: plantas noduladas; dcha planta sin nodular

Fig 2. Estrategia de aislamiento de bacterias endosimbióticas de L. mariae-josephae a partir de suelo de Chiapas